斑點叉尾鮰體型較長，體前部寬于后部，頭較小，吻稍尖，口亞端位，體表光滑無鱗，粘液豐富，側線完全，皮膚上有明顯的側線孔。頭部上下頜具有深灰色觸須4對，其中鼻須1對，頜須1對，頤須2對，長短各異，以頜須為最長，末端超過胸鰭基部，鼻須最短。鰓孔較大，鰓膜不連于峽部，頤部有較明顯而不規則的斑點，體重大于0.5公斤的個體斑點消失。具有脂鰭一個，尾鰭分叉較深，各鰭均為深灰色。體兩側背部淡灰色，腹部乳白色，幼魚體兩側有明顯而不規則的斑點，成魚斑點逐步不明顯或消失。
斑點叉尾鮰在江河、湖泊、水庫和池塘中均能產卵于巖石突出物之下，或者淹沒的樹木、樹樁、樹根之下或河道的洞穴里。斑點叉尾鮰的雄魚是典型的筑巢魚類，在與雌魚交尾后趕走雌魚，并守護受精卵發育直至孵出魚苗。通常斑點叉尾鮰產卵溫度范圍為21－29℃，最適溫度為26℃，水溫超過30℃不利于受精卵的胚胎發育和魚苗成活。在長江流域斑點叉尾鮰的繁殖季節為6－7月。體重（或年齡）較大的比體重（或年齡）較小的其產卵季節要早些。產卵時，每尾魚通常以尾鰭包裹對方頭部，雄魚劇烈顫動魚體并排出精液，與此同時，雌魚開始產卵。卵受精后發粘，相互粘結而附于水池底部。據Clemens和Sneed(1957）報道，雄魚護卵時位于卵塊上方，不斷擺動腹鰭，以達到對受精卵增氧的作用。
斑點叉尾鮰屬底棲魚類，主要棲息于湖泊、河流有砂礫、石塊的底層，喜歡在陰暗的光線條件下集群攝食，有晝伏夜出的攝食習慣。水溫4～5 ℃ 開始攝食，39 ℃ 時停食，生長溫度為5 ～ 36 .5 ℃ ，最適生長溫度為18 ～30 ℃ 。溶氧3 毫克/升以上較好，低子0 . 8 毫克/升時出現浮頭，0 . 34 毫克/升時窒息死亡。正常生長的pH 值為6 . 5 ～8 . 9 。池養條件下第1 年長至13 ～35 厘米，第2 年35 ～45 厘米，第3 年達45 ～57 厘米。