錦鯉品種的劃分主要依據其顏色分為若干品系。其鯉種來源分為緋鯉、革鯉和鏡鯉。
錦鯉共分為九大品系，約百余品種。根據色彩、斑紋及鱗片的分布情況，主要分為13個品種類型。
紅白錦鯉：錦鯉的正宗，全體純白底紅斑，不夾帶其它顏色，底應雪樣純白，紅斑濃而均勻，邊界清晰。本類型分為20多品種。
體表底色為銀白色，鑲嵌有變幻的紅色斑紋。體表底色銀白如雪，上鑲嵌有變幻多端的紅色斑紋。根據紅色斑紋的數量，生長和形狀和部位又分為：
1．二段紅白錦鯉：在潔白的魚體上，生有兩段緋紅色的斑紋，似紅色的晚霞，鮮艷奪目。
2．三段紅白錦鯉：魚體背部生有3段配上赤色的斑紋。
3．四段紅白錦鯉：銀白色的魚體上散布著4塊鮮艷的紅斑。
4．一條紅錦鯉：在雄健的魚體上，從頭部至尾柄形成一優美的紅色條帶。
5．閃電紋紅白錦鯉：魚體上從頭至尾柄有一紅色斑紋，此斑紋形狀恰似雷雨天的閃電光彎彎曲曲，妙不可言，因此而得名。
6．富士紅白錦鯉：紅白錦鯉的頭上有銀白色粒狀斑點，恰似富士山頂的積雪。但是此斑點只出現在1齡或2齡魚體上，長大后有時會消失。
7．拿破侖紅白錦鯉：魚體腹部兩側的斑紋酷似法國統治者拿破侖佩戴的帽子。
8．御殿櫻錦鯉：小粒紅斑聚集成葡萄狀的花紋，均勻地分布在魚體背部兩側。
9．大正三色錦鯉：白底上有紅、黑斑紋，頭部具紅斑而無黑斑，胸鰭上有黑色條紋。此品系可分為10余品種。
魚體底色雪白，又浮現出緋紅、烏黑兩色斑紋。
10．口紅三色：嘴吻上有小紅斑的大正三色。