發酵過程注意適當供氧與翻堆（溫度升至75℃或以上時要翻倒幾次），升溫控制在65℃左右，溫度太高對發酵物有影響。
翻拋機可對物料打散、粉碎，并帶走部分水分 。 即可在開闊場地，也可在車間大棚中實施作業。該機一大技術突破在于整合了物料發酵后期的破碎功能，同時在翻拌的同時有氧氣會進入，加快發酵，減少臭味。
高溫中，雞糞里的病菌、蟲卵會被殺死，大分子蛋白分解成利于農作物吸收的小分子蛋白。生物發酵過程中可以有效的防止糞便里硫化氫、胺氣、吲哚等有害、惡臭氣體的產生，完全除去雞糞中的臭味。 隨著高溫、翻堆，原料里的水分會逐漸降低，一般的發酵周期是12-15天，發酵完成，就可以收堆了，水分也降至35%左右。可以繼續下一步的深加工，篩分、粉碎、造粒等。
有機肥翻堆機整機動力均衡適宜、耗能低、產量大，降低了生物有機肥生產成本。