一般在9月上旬施基肥，這時肥料有充分的時間腐熟，能讓樹體在休眠前吸收利用。此時施肥切斷的根能很快愈合并萌發大量吸收根，提高樹體對肥料的吸收利用率。施肥種類以腐熟的農家肥為主，配合少量化肥。一般幼樹每株施土雜肥50至75公斤，秋施基肥不宜過深，以40至50厘米為宜。幼樹可采用溝施法，健壯樹采用撒施法，如發現樹體有缺素癥，可適當混入少量微量元素。
秋季櫻花根系生長高峰到來之前，結合基肥的施入，深翻樹盤，可增加深根量，蓄水保墑，提高地溫。將樹盤內枯枝、落葉、雜草等清理干凈，集中燒毀，以消滅越冬蟲原和菌源。