冷藏集裝箱（Reefer container）是指一種有良好隔熱，且能維持一定低溫要求，適用于各類易腐食品的運送、貯存的特殊集裝箱。
冷藏集裝箱的基本類型有保溫集裝箱、外置式冷藏集裝箱、內藏式冷藏集裝箱、液氮和干冰冷藏集裝箱、冷凍板冷藏集裝等。
專為運輸要求保持一定溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。適用裝載肉類、水果等貨物。冷藏集裝箱造價較高，營運費用較高，使用中應注意冷凍裝置的技術狀態及箱內貨物所需的溫度。
此外，有一種低壓冷藏集裝箱與氣調冷藏集裝箱類似，這種集裝箱是將果蔬置于低壓環境中進行儲運。箱內壓力為1333～10666 Pa，相對濕度90%～95%，溫度一2℃～+16℃。氧的含量為（0.1±0.03）%，要進行換氣，以便限制乙烯和 等有害氣體。低壓冷藏集裝箱由制冷系統、真空系統和動力系統組成。制冷系統用于降低溫度；真空系統用于排除箱中的空氣和水汽；動力系統用于柴油發電，供集裝箱用電。
冷藏集裝箱可用于多種交通運輸工具進行聯運
可以從產地到銷售點，實現“國到國”直達運輸，
一定條件下，可以當作活動式冷庫使用
使用中可以整箱吊裝，裝卸效率高，運輸費用相對較低。
裝載容積利用率高，營運調度靈活，使用經濟性強。
新型冷藏集裝箱結構和技術性能更合理先進，有廣泛適用性。