糞池主要是傳統的三級化糞池，其作用為沉淀截留糞便，一般需經過30天厭氧發酵，減少糞便容積，降低污水濃度后匯入生活污水排放管網。但當化糞池底部因糞渣沉溺板結，導致留給糞水發酵的空間及時間不足，就直接影響無害化處理的效果，當糞渣板結達到一定高度后，糞便就相當于未經任何處理直接排出化糞池，此時，化糞池即已屬名存實亡，淪為過糞池，而不具任何化糞效果了。此外，在化糞池密封程度較高的情況下，如果沼氣滿溢，甚至可能造成沼氣爆炸。環衛專家指出，一個按標準建造的化糞池，如果一直得不到清理，經過1-2年的時間，糞渣板結至化糞池高度的2/3時，就足以使化糞池形同虛設。在這些過糞池的出口處可明顯看到未沉淀的黃色糞便流出，并排放市政下水道，甚至可能污染長江。
隨著因化糞池發生滿溢的次數增多，市民想得到及時解決的心情也驟然加深。至此，社會上從事糞便清運隊伍也應運而生。由于這些糞便清運隊伍在從事作業時未進行從業資格審核許可，一開始就無法進行有效把關。造成這些糞便清運隊伍在從事作業時，為了業務量，壓低清運成本，無視法律、法規的規定方式進行清運和處置。調查得知，有的糞便裝載車輛一路運載一路滴落，有的糞渣就就近散倒城市角落或傾倒城市江河里。使城市環境受到嚴重的二次污染。再者，因地面上外力造成強烈震動，使池體出現裂縫，造成糞便水滲漏地下，污染地下水源，及化糞池長期不清理造成排出污水嚴重超標等，會使城市環境受到二次污染。長時間不清理會引起爆炸。化糞池長期欠缺清理造成極大的危害。
化糞池的清掏周期與糞便污水溫度、氣溫、建筑物性質及排水水質、水量有關。設計清掏周 期過短，則化糞池糞液濃度過高，與實際清掏周期差距過大，影響正常發酵和污水處理效果，甚至造成糞液漫溢， 影響環境衛生。設計清掏周期過長，則化糞池容積過大，增加造價。《建筑給水排水設計規范》（GBJ15-88）（以下簡稱《規范》）要求清掏周期為3～12個月，實際設計中多取3～9個月，而酸性發酵階段的酸性發酵期為3個月，酸性減退期為5個月左右。實踐證明：清掏周期的取定，應兼顧污水處理效果、建設造價、管理三個方面因素清掏周期一般不宜少于12 個月。
過糞管位置 過糞管安裝的位置關系到糞便流動方向，流程長短，是否有利于厭氧和能否有效阻流糞皮、糞渣、以及保持一、二池的有效容積，新鮮糞便進入糞池后，多集中在上層形成糞皮，然后逐漸疏松崩解，比重較大的下沉形成糞渣，糞皮與糞渣之間為稀糞液。寄生蟲卵一般都集中在糞皮和糞渣中，因此，過糞管位置要放在寄生蟲卵較少的中層糞液。過糞管位置較好的設置應分別斜插安裝在兩堵隔墻上：其中池到第二池過糞管下端位置在池的下1/3處，上端在第二池距池頂100mm左右：第二池到第三池過糞管下端位置在第二池的下端1/3或中部1/2處、上端在第三池距池頂100左右，過糞管與隔墻的水平夾角應呈60度。附有關平面圖。