工程設計不合理
這種現象比較少見，主要是在一些小型的凈化級別要求不太高的潔凈室建造上。現在凈化的競爭比較激烈，一些施工單位為了獲得工程，在投標中給出了較低的報價。在后期施工中，利用一些單位不太懂行的情況，偷工減料，使用功率較低的空調通風壓縮機組，使送風功率與凈化面積不匹配，導致潔凈度不合格。
送風管或過濾器密封不好
這種現象是施工粗糙造成的，在驗收時會表現出在同一系統中某個房間或局部不合格，改進的方法是，送風管采用漏光試驗法檢漏，過濾器用粒子計數器對過濾器的斷面、封膠、安裝框架進行掃描，找出泄露位置，精心密封。
凈化空調系統沒有清掃干凈
在施工過程中，整個凈化空調系統，尤其是送、回風管道都不是一次完成，施工人員和工環境都會造成通風管道和過濾器的污染。如不清潔干凈，將直接影響檢測結果。改進措施是，邊施工邊清潔，面前一段管道安裝完成清潔后，可用塑料薄膜密封，避免環境等造成的污染。
實驗室對器材有比較高的需求，一定得根據實驗室的具體環境來選用不同的空氣凈化器，防止產生噪聲、粉塵污染或是干擾其他實驗室設備的使用。對于實驗室而言，應該選擇特定的實驗室空氣凈化器。比如在化學實驗室，空氣凈化器應該能夠有效清除室內所產生的有毒酸堿性化學物質、有機異味氣體，有效地降解揮發在空氣中的甲醛、苯、氨等污染物，達到有效、抗污除臭、凈化空氣的目的。
