潔凈區
（1）潔凈室內表面平整、光滑、無脫落物，墻角應弧形，有防塵、蟲、污設施。
（2）人和物進入潔凈室應有雙層窗。門向潔凈度高一側開。應該設置門。
（3）人流、物流分開并固定路線。
（4）水、電線路暗敷。管道及風口與頂棚連接處密封，電氣管路、墻上電器與墻體連接處密封，吸頂燈與頂棚連接處密封。
（5）操作臺臺面不應用木頭、油漆面，應易清潔。
送風管或過濾器密封不好
這種現象是施工粗糙造成的，在驗收時會表現出在同一系統中某個房間或局部不合格，改進的方法是，送風管采用漏光試驗法檢漏，過濾器用粒子計數器對過濾器的斷面、封膠、安裝框架進行掃描，找出泄露位置，精心密封。
回風管道或回風口設計、調試不好
在設計方面的原因，有時因空間所限未能采用“頂送側回”或者回風口數量不夠，在設計方面的原因排除后，回風口的調試也是重要的工工環節。如果調試不好，回風口阻力過大，回風量小于送風量，也會造成潔凈實驗室潔凈度不合格。另外在施工中，回風口離地面的高度對潔凈度也有影響。
過濾裝置性能
室內空氣凈化主要靠過濾裝置，經過優良的過濾器可以保證向室內輸送潔凈空氣。對5μm以上顆粒濾除效果達到99、99%以上，可有效去除空氣中的各種顆粒，否則不能保證對微生物的潔凈效果。
足夠的換氣次數
由于潔凈實驗室內人員及操作活動，可以不斷產生塵埃和顆粒，這些顆粒需要不斷的換氣將其帶走，如果沒有足夠的換氣量，將會使室內顆粒濃度越來越高。
