無塵室系統
室內的空氣凈化系統可分為水平層流、垂直層流和亂流。選擇氣流形式一則參照慣例，二則取決于房間的工作參數。
潔凈度與換氣次數
房間的潔凈度取決于單位時間的換氣次數，因此慎密考慮房間的工作性質、以及生產工藝要求，再決定凈化系統的技術參數。
潔凈實驗室的潔凈度等級區分
1、A 級
高危操作區，如罐裝區、置放膠塞桶和與無菌藥品直接碰觸的敞口包裝材料的區域及無菌裝配或接入操作的區域，應該用單向流操作臺（罩）保持該區的環境狀態。單向流系統在其工作區域需要均勻供風，流速為0.36-0.54m/s（指導值）。應該有數值證明單通道流的情況并經過認證。在封閉空間的隔離操作器或手套箱內，可采用較低的風力。
2、B 級
指無菌配置和罐裝等高危操作A 級凈化區所在的背景區域。
3、C 級和D 級
指無菌制劑加工過程中主要程度較低操作流程的凈化區。
回風管道或回風口設計、調試不好
在設計方面的原因，有時因空間所限未能采用“頂送側回”或者回風口數量不夠，在設計方面的原因排除后，回風口的調試也是重要的工工環節。如果調試不好，回風口阻力過大，回風量小于送風量，也會造成潔凈實驗室潔凈度不合格。另外在施工中，回風口離地面的高度對潔凈度也有影響。
合適的溫、濕度環境
潔凈實驗室內除人員產熱散濕之外，還有設備散熱、濕以及建筑物傳熱，致使室內溫濕度發生變化，影響潔凈度。需要靠空調系統，以維持潔凈實驗室內相對恒定的溫濕度，保證微小氣候穩定，有利于維持潔凈實驗室的質量。
