一、是利用過濾器有效地控制送入室內的全部空氣的潔凈度，由于微生物都會依附在微粒上，微粒過濾同時也濾掉了微生物；
二、是利用合理的氣流組織排除已經發生的污染，由送風口送入潔凈空氣，使室內產生的微粒和被潔凈空氣稀釋后強迫其由回風口進入系統的回風管路，在空調設備的混合段和從室外引入的經過過濾的新風混合，再經過進一步過濾后又進入室內，通過反復的循環就可以把污染控制在一個穩定的水平上，這個水平就應該低于相應要求的潔凈度級別；
三、通過調整，使不同級別潔凈室室內的空氣靜壓大于10帕（包括與非潔凈區），與室外大氣大于10帕，防止外界污染或交叉污染從門或各種縫隙部位侵入室內。