第二池
起進一步發酵、沉淀作用，與池相比，第二池的糞皮和糞渣的數量減少，因此發酵分解的程度較低，由于沒有新糞便的進入，糞液處于比較靜止狀態，這有利于漂浮在糞池中的蟲卵繼續下沉。
第三池
主要起儲存糞液的作用。經前二格處理的糞液進入第三池，基本上已經不含寄生蟲卵和病原微生物，達到了糞便無害化要求，可以供農田直接施肥。
用防濺式直通便器和水封便器則不必下接進糞管第二池頂應密封，但也要留有清渣口，第三池蓋頂留有出糞口，出糞口用蓋密封。
其它配套物品
潔凈衛生紙存放箱，便紙簍、掃帚及刷子，盛水器皿、照明設施、通風設備等。
化糞池的清掏周期與糞便污水溫度、氣溫、建筑物性質及排水水質、水量有關。設計清掏周 期過短，則化糞池糞液濃度過高，與實際清掏周期差距過大，影響正常發酵和污水處理效果，甚至造成糞液漫溢，影響環境衛生。
轉運作業時，糞便不得污染水體和作業場地。沖洗作業場地的污水應經適當處理，排入污水管網或收集池，不得直接排入附近水體。
將人力收集車的糞便轉運到機動車時，應保持轉運作業的緊密銜接，不得任意將糞罐、糞桶、手推糞車停放在主要道路上。
卸糞時應謹慎操作，不得將糞便潑灑在卸糞口周圍地面。作業結束，應及時清洗卸糞口及作業場地。
糞便轉運站(場、碼頭)應有滅蠅措施。在可視范圍內，蒼蠅不超過3只/次，無蛆，臭味不超過4級。