無菌實驗室也叫無菌試驗室主要用于微生物學、生物醫學、生物化學、動物實驗、基因重組以及生物制品等研究使用的實驗室，統稱潔凈實驗室-生物實驗室。
無菌室也稱接種室，是系統接種、純化菌種等無菌操作的專用實驗室。在微生物工作中，菌種的接種移植是一項主要操作，這項操作的特點就是要保證菌種純種，防止雜菌的污染。在一般環境的空氣中，由于存在許多塵埃和雜菌，很易造成污染，對接種工作干擾很大。
操作人員用肥皂洗手后進入緩沖間換拖鞋，用75%乙醇棉球擦手，穿戴工作衣帽、口罩。將所需物品剝去牛皮紙及外包裝，從傳遞窗移入操作間，再用0.1%苯扎溴銨溶液泡手后進入操作間，在乙醇(或煤氣燈)火焰區(火焰高度3-5cm)操作。
無菌操作工作區域應保持清潔及寬敞，必要物品，例如試管架、吸管吸取器或吸管盒等可以暫時放置，其它實驗用品用完即應移出，以利于氣流之流通。實驗用品以70%的酒精擦拭后才帶入無菌操作臺內。實驗操作應在抬面之中央無菌區域，勿在邊緣的非無菌區域操作。