錦鯉主要觀賞背面，所以選擇上下較扁、剖面是扁橢圓形、整體呈紡錘形的，而色彩則根據培育目的來選擇相應體色的親魚。例如，要培養紅白錦鯉，就應從紅白品系中選擇健康的雌、雄魚作親魚。如果在培養繁殖用錦鯉時，將不同品系親魚放在一口大魚塘中任其自然繁殖，這樣顯然不能獲得滿意的結果。
繁殖前，將雌、雄魚分開飼養，繁殖時再放回產卵池中。作為產卵池一般都采用小型水泥池。池的形狀不限，面積在20m 2 左右便可。池子太小，親魚產卵時常常會跳躍到岸上；太大則不利于水質管理和繁殖前魚池的工作。
挑選工作在孵出后3個多月內進行3次～4次。挑選因品種的不同、生長速度和斑紋出現時間等方面的差異而略有不同。挑選時，首先去掉畸形、色彩不鮮艷的魚，還要依照花紋的生長狀況和質量標準進行挑選。
紅白系錦鯉中應淘汰紅斑紋顏色淡的個體；黃金系錦鯉頭部無光澤、鱗片覆蓋不好、魚體雜斑多、胸 鰭生長不好的個體均應淘汰。錦鯉在飼養過程中淘汰率很高：親魚產10萬粒卵，獲仔魚6萬尾～7萬尾，夏花3萬尾，經次挑選剩1.6萬尾，到秋季越冬時只剩3600尾左右。