同仁醫院現有中國工程院院士1名，北京學者3名，長江學者1名，享受政府特殊津貼專家11名，獲、北京市突出貢獻專家12名。作為首都醫科大學第四臨床醫學院，醫院承擔著重要的教學任務。醫院現有學位點28個，其中博士學位點13個。碩士生導師114人，博士生導師41人。擁有15個北京市住院醫師培訓基地。
改革開放以來，醫院共獲得省部級以上科技成果獎勵138項，其中8項，獲得國家自然科學基金資助項目253項。
1886年，清光緒十二年，美國基督教“衛理公會”的蘭大夫、衛大夫在崇文門的孝順胡同開辦名為“同仁醫院”的眼科診所。
1899年，“衛理公會”的霍甫金斯·賀慶先生捐資教會在北京東交民巷東口(現北京同仁醫院地址)使館區內選定并購妥院址，開始籌備興建工程。
1913年，醫院在西山選定基地建造樓房，命名為“天然療養院”，專門結核病。
1914年，醫院南樓建成。同年，西病房樓落成。醫院的病房設在西樓，分為三層，有眼科、內科和外科病房，眼科約占1/2。
1917年，醫院北樓落成，賀慶院長得到了中華博醫學會的資助，聘請美國醫生潘提司先生來院工作，設立牙科。1918年與協和醫院合辦牙科專門醫學校。
1918年，由于賀慶家族的捐資，新址落成后，英文名稱改為“賀約翰氏捐建美以美會醫院”。1927年賀慶大夫退職以后，醫院英文名稱再次更改為“賀氏紀念醫院”。
1942年，日偽北京特別市公署衛生局接收同仁醫院全部資產，日偽北京市衛生局將同仁醫院改為“市立第二醫院”，賀慶院長被迫離職。
1945年5月，醫院又由日本“開發醫療組合”接管，改名為“開發醫院”。
1945年11月14日，衛理公會會督江長川、美國代表白輔德致函北平衛生局，要求將醫院收回管理。次年1月，衛理公會收回了醫院，恢復使用同仁醫院的名稱。
1949年4月，在中共北京市委及市總工會的領導下，醫院建立了工會。同年11月，建立了新民主主義青年團。
1952年7月，醫院與北京市婦嬰醫院合并，更名為“北京市同仁醫院”，增設了婦產科、小兒科。
1953年8月，北京市人民政府正式接管醫院，更名為“北京市立同仁醫院”。
1955年，醫院更名為“北京市同仁醫院”。
1958年10月，北京市政府決定將同仁醫院的神經外科全部遷到以神經外科為中心的宣武醫院。
1959年，眼科研究所成立，設有微生物、病理、生理研究室，羅宗賢教授任所長。
1966年，文化大革命開始后醫院更名為“北京市工農兵醫院”。
1979年，醫院復名“北京市同仁醫院”。
1994年，更名為“首都醫科大學附屬北京同仁醫院”。
作為具有同仁特色的科室，眼外傷?？铺貏e注意與口腔頜面外科、神經外科、鼻科等兄弟?？频暮献?，在交叉復合學科發展上在國內獨樹一幟。眼外傷?？婆c耳鼻喉科成立了鼻眼相關中心，聯合開展了復合路徑下的眶壁骨折整復術、多重療法的視神經管減壓術、合并鼻骨骨折的鼻淚道手術和眶-鼻竇異物取出、眶面復合創傷多學科多層次多斷面聯合;與神經外科合作，率先開拓經顱顯微視神經管減壓開放術、眶顱異物取出術，大大提高了手術成功率。
角膜塑形鏡門診現設立在北京同仁醫院崇文門院區東區一樓視光中心門診，隸屬眼科醫學視光中心，現有醫生6人，均為副高以上職稱，專業擅長為眼視光醫學及角膜病學，在復雜角膜屈光問題，近視眼防控，角膜塑形鏡驗配，硬性角膜接觸鏡(RGP)驗配等領域具有豐富的臨床經驗。
服務人群：18-55歲的近視、散光、遠視等屈光不正，希望通過手術矯正獲得更好視覺體驗的患者。
