辦理預付款保函需要5到10個工作日。
《人民法院關于審理獨立保函糾紛案件若干問題的規定》 第十一條
獨立保函具有下列情形之一，當事人主張獨立保函權利義務終止的，人民法院應予支持：
（一）獨立保函載明的到期日或到期事件屆至，受益人未提交符合獨立保函要求的單據；
（二）獨立保函項下的應付款項已經全部支付；
（三）獨立保函的金額已減額至零；
（四）開立人收到受益人出具的免除獨立保函項下付款義務的文件；
（五）法律規定或者當事人約定終止的其他情形。獨立保函具有前款權利義務終止的情形，受益人以其持有獨立保函文本為由主張享有付款請求權的，人民法院不予支持。
如果保函中未曾寫明預付款保函的擔保金額，將隨保函歸還金額而相應減少，則很可能出現預付款已大部分償還，而保函額不減的局面，業主隨時可能全額沒收保函，而承包商卻不擁有全額預付款（因為很可能在業主沒收保函時，承包商已經償還了部分預付款）。
工程招投標后為了使交易時更加放心有保障，都會要求對方開具一份預付款保函，這樣既可避免交易中爽約的損失，在任何銀行開具預付款保函的企業，首先是銀行的開戶會員，然后都必須是合法的企業有相關的營業執照等合法文件、有足夠的業務資質等等，然后就可以在銀行申請預付款保函，審核通過后就可以開出了。
a．因為預付款保函的保證人即開立保函的銀行承擔的是性、直接的付款責任，所以我們要求出具保函的銀行應是國際流的，信譽好的大銀行，只有這樣買方的利益才能得到保障。
b．出具保函的銀行要和買方的轉遞銀行或往來銀行有代理關系，以便買方銀行核對印鑒或密押以確定保函的真偽。