北京301醫院擁有5位中國工程院院士，1百多名技術三級以上專家，1千多名高職專業技術人員。醫院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進步一等獎7項，二等獎20項，國家發明獎2項，軍隊科技進步一等獎21項。
北京301醫院先后被評為“國際模范愛嬰醫院”、“全國百佳醫院”、“全國百姓放心醫院”、“全國百姓放心示范醫院”、“全軍為部隊服務先進醫院”，榮獲全國衛生系統“文化建設創新獎”、國家衛生部授予“醫院改革創新獎”。
令狐恩強率先定名完善消化內鏡隧道技術，模糊了消化內外科的界限，替代了一批傳統外科手術；率先提出基于保持人體解剖結構不變條件下，達到祛除疾病目的的超級微創手術新概念，替代長期存在以切除器官為代價的手術模式，為未來手術方法學與器械研發指明了方向。
令狐恩強說，在2010年前后，我國提出消化內鏡診治新模式的概念，來踐行早診早治的理念。一方面是把檢查切入點從有癥狀期提前到無癥狀期，另一方面則是形成以消化內鏡治 療為主，外科手術切除為輔，放化療為補充的一套全新的治 療概念。該理念保證了患者能在早期就能被發現，并進行有效的內鏡下治 療，具有良好的社會意義和經濟效益。
