北京兒童醫院精神科主要服務內容為心理健康相關的問題和疾病的預防、診斷、治 療和康復，包括：注意缺陷多動障礙(多動癥)、抽動障礙(抽動癥)、孤獨癥譜系障礙、抑郁癥、雙相情感障礙、精神分裂癥、情緒障礙、品行障礙等;各種兒童青少年心理問題的咨詢，包括學習困難、人際溝通、網絡成癮、科學育兒、健全人格培養、壓力管理等。
主要的方法與服務模式為：、心理、行為、康復訓練、健全人格培養為核心的綜合模式和預防-早期診斷--康復為一體的連續式服務機制。非方法包括：心理、沙盤、藝術、音樂、生物反饋、物理、認知功能訓練、社交技能訓練、壓力與情緒管理等。
多年來，為方便患者就醫，北京兒童醫院始終堅持24小時接診。醫院積極踐行公立醫院改革，推進預約掛號工作，優化服務流程，改善患者就醫體驗，受到國家衛生健康委的肯定和廣大群眾的認可。醫院還承擔了上級部門委派的重大兒童傳染病防治、抗震救災支援、突發公共衛生事件救治等醫療任務。
北京兒童醫院精神科一直堅持心理健康應該從娃娃抓起。在兒童心理健康領域做了大量探索的工作，其中以腦與認知神經科學為主。先后承擔和參與了一系列重大的兒童神經發育領域的科研項目。
