醫院總用地面積5.53萬平方米，總建筑面積15.7萬平方米；預防研究區（門頭溝西山園區）總用地面積7.33萬平方米，總建筑面積目前為3.7萬平方米，未來將達到9.2萬平方米。醫院設有36個病房，26個手術室（其中包含5個復合技術手術室），17個導管室，1521張編制床位數，實際開放床位數1291張。在職員工3571人，中高級職稱專業技術人員1440人（數據截至2020年12月31日）。同時，配備有血管造影機、雙源CT、核磁共振、PET-CT等與世界接軌的醫療科研設備。
中國醫學科學院阜外醫院（以下簡稱阜外醫院），是三級甲等心血管病專科醫院，目前正朝向綜合型醫院轉型發展。阜外醫院是國家心血管病中心所在地，是心血管疾病國家重點實驗室、國家心血管疾病臨床醫學研究中心建設承擔單位，是獲得全國首批“輔導類”國家醫學中心和全國國家醫學中心實質落地項目建設單位，以診治各種復雜、疑難和重癥心血管疾病而享譽國內外，已成為世界上的心血管疾病診治中心和集醫療、科研、預防和人才培養于一體的醫學研究與教育中心。
阜外醫院始建于1956年，2009年中央編辦批復成立國家心血管病中心，正式形成“中心—醫院”一體化格局。本部阜成門院區總用地規模5.53萬平方米，總建筑面積15.7萬平方米；門頭溝西山院區總用地規模7.33萬平方米，其中西山一期建筑面積3.7萬平方米；西山二期項目建設正在加速推進，建筑面積5.62萬平方米。
技術協作網絡與專科醫聯體建設
阜外醫院完成中國心血管疾病防治領域近代發展史上影響力的工作，建立了心血管技術培訓網絡。1982年創建“全國心血管病臨床技術協作培訓中心”，1988年更名為“中國心血管技術協作培訓中心”。自2009年起，阜外醫院在全國科學布局，構建分級管理與培訓體系，推廣適宜有效的心血管疾病防治技術。通過推動全國技術協作網絡建設，協作單位已覆蓋全國282家醫院，帶動區域醫療服務能力提升。
阜外醫院陸續探索建立了涵蓋全國縣域層面的高血壓、心血管代謝、心力衰竭、心肌病、肺動脈高壓、生活方式醫學、結構性心臟病、先心病8個專科聯盟，持續統籌調動內外部資源，推進專科醫聯體規范化建設，夯實資源輸出體系，為協作單位提供、可持續的幫扶，提升基層獲得感，推進各學科專科醫聯體建設邁出實質步伐。