現有的檔案柜（架）大都未給此種擺放方式留下足夠的空間，因此選用橫式檔案盒時應同時考慮檔案柜（架）的狀況。機關單位在選用檔案盒時，兩種格式的檔案盒只能選用一種，以簡便管理、保證檔案盒上架后整齊、美觀。
檔案盒發展進入第二個時期，也就是無酸紙檔案盒。
檔案文件盒用的紙張含酸量的高低是其壽命的指標，無酸紙指的是用pH值為7.0或更高的做出的紙，使用壽命可長達兩百年。
無酸紙檔案盒：顏色均勻，色淡，紙張表面光潔平整。相較于早期的牛皮紙檔案盒，它不褪色，不變質，防霉還防蟲，因而能能夠更好的進行檔案管理，保障了檔案的歸檔與科學分類，做到分工細化。
檔案盒應根據擺放方式的不同，在盒脊或底邊設置全宗號、年度、保管期限、起止件號、盒號等必備項，并可設置機構（問題）等選擇項。其中，起止件號填寫盒內件文件和后一件文件的件號，起件號填寫在上格，止件號填寫在下格；盒號即檔案盒的排列順序號，按進館要求在檔案盒盒脊或底邊編制。
檔案盒使用原則
將歸檔文件按順序裝入檔案盒，并填寫檔案盒盒脊及備考表項目。不同年度、機構（問題）、保管期限的歸檔文件不能裝入同一個檔案盒。
1、不同形成年度的歸檔文件不能放入同一檔案盒；
2、不同保管期限的歸檔文件不能放入同一檔案盒；
3、放入同一檔案盒的歸檔文件應按照檔號先后進行排序，小號在前，大號在后；
4、檔案盒盒脊和備考表的填寫應與盒內檔案的情況一致。
