投標保函辦理手續費（銀行保函）得根據辦理方式來定，如果企業自己去銀行辦理，交全額保證金，然后按照季度交手續費，大概在幾百塊不等，還有一種方式是通過占用第三方擔保公司在銀行的額度出的保函（分離式保函），這種保函跟企業自己去出保函效果一樣，出的保函上不體現擔保公司，只體現受益人、申請企業、項目名稱、保函金額和期限等信息，這種費用也是幾百塊，但是不用交保證金。
履約保函和保證金的區別：
履約保函和保證金的區別在于履約保函在辦理的時候手續非常的繁瑣，但是在保函當中會有一個明確的有效期，在到了這天之后，乙方的錢就會自動從銀行獲得自由，而不需要甲方同意或者是不同意。
而辦理履約保證金的話，那么總體的手續就比較簡單了，只需要直接交錢給買方或者是是交易中心，就能夠對于我們的合同進行現金的保障，但是履約保證金只能夠保證合同的正常進行，到了約定時間之后，我們的本金并不是能夠馬上就收回來的。
因此，雙方選擇履約保函是一個比較明智的選擇。
商業保函指的是，除了銀行以外，由其他商業機構出具的保函，一般出具保函的公司都是專業的擔保機構或商業機構的信用擔保。
商業保函也是包括了很多種的，比如預付款保、農民工工資支付保函、質量保函、投標保函、履約保函等，這些都是屬于商業保函。
商業保函的費用相對于銀行辦函要便宜很多，有的可能低于50%以上。這對于建筑企業來說，相對還是比較節約成本的。
履約保證金和質保金的區別：
，資金來源不同。履約保證金一般來自承包方的流動資金，在施工前付給發包方。質量保證金是發包方與承包方在建設工程承包合同中約定或承包方在工程保修書中承諾，在工程竣工驗收交付使用后，從應付的建設工程款中預留的用以維修工程在保修期限和保修范圍內出現的質量缺陷的資金。
第二，約束的目的不同。履約保證金的目的是擔保承包人完全履行合同，主要保證工期和質量符合合同的約定。履約保證金的功能，在于承包人違約時，賠償發包人的損失，也即如果承包人違約，將喪失收回履約保證金的權利，且，并不以此為限。質量保證金則更多的是一種約束工程質量的手段。
第三，保證金的比例和返還時間不同。履約保證金的比例為工程造價的5%-10%，具體執行比例由發包人根據工程造價情況確定，承包人順利履行完畢自己的合同義務，發包人必須全額返還保證金。質量保證金比例可參照政府投資的建設項目的要求按工程造價5%左右預留保證金，具體比例雙方可協商，在工程竣工驗收交付使用后開始計算缺陷責任期，責任期內承包人須認真履行合同約定的責任，到期后，承包人向發包人申請返還保證金。